First record of Trichodina heterodentata (Ciliophora: Trichodinidae) in banded knifefish Gymnotus carapo (Gymnotidae) cultured in Brazil / Primeiro registro de Trichodina heterodentata (Ciliophora: Trichodinidae) em tuvira Gymnotus carapo (Gymnotidae), cultivado no Brasil

The aim of this study was to report the first record of Trichodina heterodentata in banded knifefish Gymnotus carapo. Banded knifefish cultivated in the municipality of Jataí, state of Goiás, in the central western region of Brazil, experienced fish mortality rates of 3-4% per tank. Macroscopic analysis found that fish had lesions on their skin and gills. Smears of the integument and gills were confectioned and air-dried at room temperature and impregnated with silver nitrate to identify the Trichodinidae species causing the lesions. The trichodinid were identified as T. heterodentata, and their characteristics were compared to those from T. heterodentata recorded from other species of host fish. It was observed that the presence of T. heterodentata was associated with inadequate fish management, low water quality, high rates of stocking density, and inadequate nutritional management.

O objetivo deste estudo foi relatar o primeiro registro de Trichodina heterodentata em tuviras Gymnotus carapo. Um cultivo de tuviras no município de Jataí, estado de Goiás, na região Centro-Oeste do Brasil, apresentou taxas de mortalidade de peixes de 3-4% por tanque. A análise macroscópica constatou que os peixes tinham lesões na pele e brânquias. Raspados do tegumento e brânquias foram confeccionadas e secas ao ar à temperatura ambiente e impregnadas com nitrato de prata para identificar as espécies de Trichodinidae causadoras das lesões. Os tricodinídeos foram identificados como T. heterodentata, e suas características foram comparadas com as de T. heterodentata registradas para outras espécies de peixes hospedeiros. Observou-se que a presença de T. heterodentata estava associada ao manejo inadequado dos peixes, baixa qualidade da água, altas taxas de densidade de estocagem e manejo nutricional inadequado.

Occurrence and diversity of ciliated protozoa in the most commonly consumed leafy greens in Brazil: a qualitative study

Ciliated protozoa are an ubiquitous group of eukaryotes that have been poorly reported on leafy greens. The present study aimed to verify the occurrence and diversity of ciliated protozoa in the leaves and roots of three of the most commonly consumed leafy greens in Brazil ­ lettuce, rocket and coriander. The vegetable samples were washed by manual agitation (3 minutes) in two different media (mineral water and Page ́s Amoeba Saline solution). After washing, the contents were incubated in Petri dishes and aliquots were removed for microscopic identification and in vivo observation. A total of 21 ciliated protozoa species were found, most of which were bacterivorous. Leafy greens have commonly been associated with foodborne outbreaks and ciliated protozoa, which although they are not a Public Health concern, can act as "Trojan Horses" harboring bacteria, viruses and other protozoa cysts and oocysts and can suggest a new route towards microbiological quality related to the food chain. This is the first report of ciliated protozoa on leafy greens consumed in Brazil. (AU)

Os protozoários ciliados constituem um grupo onipresente de eucariotos pouco relatados em vegetais folhosos. O presente estudo teve como objetivo verificar a ocorrência e a diversidade de protozoários ciliados nas folhas e raízes de três dos vegetais folhosos mais consumidos no Brasil - alface, rúcula e coentro. As amostras de vegetais foram lavadas por agitação manual (3 minutos) em dois meios diferentes (água mineral e Solução Salina para Ameba). Após a lavagem, o conteúdo foi incubado em placas de Petri e alíquotas foram retiradas para identificação microscópica e observação in vivo dos organismos. Um total de 21 espécies de protozoários ciliados foi encontrado, a maioria das quais era bacterívora. Tais hortaliças têm sido comumente associadas a surtos transmitidos por alimentos e os protozoários ciliados que, embora não sejam um problema de saúde pública, podem atuar como "Cavalos de Tróia" ao abrigar bactérias, vírus além de cistos e oocistos de protozoários o que pode sugerir uma nova rota para a avaliação da qualidade microbiológica relacionada à cadeia alimentar. Este é o primeiro relato de protozoários ciliados em folhas verdes consumidas no Brasil. (AU)

Occurrence and diversity of ciliated protozoa in the most commonly consumed leafy greens in Brazil: a qualitative study / Ocorrência e diversidade de protozoários ciliados nos vegetais folhosos mais consumidos no Brasil: um estudo qualitativo

Ciliated protozoa are an ubiquitous group of eukaryotes that have been poorly reported on leafy greens. The present study aimed to verify the occurrence and diversity of ciliated protozoa in the leaves and roots of three of the most commonly consumed leafy greens in Brazil – lettuce, rocket and coriander. The vegetable samples were washed by manual agitation (3 minutes) in two different media (mineral water and Page ́s Amoeba Saline solution). After washing, the contents were incubated in Petri dishes and aliquots were removed for microscopic identification and in vivo observation. A total of 21 ciliated protozoa species were found, most of which were bacterivorous. Leafy greens have commonly been associated with foodborne outbreaks and ciliated protozoa, which although they are not a Public Health concern, can act as “Trojan Horses” harboring bacteria, viruses and other protozoa cysts and oocysts and can suggest a new route towards microbiological quality related to the food chain. This is the first report of ciliated protozoa on leafy greens consumed in Brazil.

Os protozoários ciliados constituem um grupo onipresente de eucariotos pouco relatados em vegetais folhosos. O presente estudo teve como objetivo verificar a ocorrência e a diversidade de protozoários ciliados nas folhas e raízes de três dos vegetais folhosos mais consumidos no Brasil - alface, rúcula e coentro. As amostras de vegetais foram lavadas por agitação manual (3 minutos) em dois meios diferentes (água mineral e Solução Salina para Ameba). Após a lavagem, o conteúdo foi incubado em placas de Petri e alíquotas foram retiradas para identificação microscópica e observação in vivo dos organismos. Um total de 21 espécies de protozoários ciliados foi encontrado, a maioria das quais era bacterívora. Tais hortaliças têm sido comumente associadas a surtos transmitidos por alimentos e os protozoários ciliados que, embora não sejam um problema de saúde pública, podem atuar como “Cavalos de Tróia” ao abrigar bactérias, vírus além de cistos e oocistos de protozoários o que pode sugerir uma nova rota para a avaliação da qualidade microbiológica relacionada à cadeia alimentar. Este é o primeiro relato de protozoários ciliados em folhas verdes consumidas no Brasil.

Morphological and Morphometric Characterization of Eodinium posterovesiculatum (Ciliophora, Ophryoscolecidae) in Brazilian Cattle

Abstract The morphological variability of Eodinium posterovesiculatum (Ciliophora, Trichostomatia) has been interpreted in different ways: four distinct species or four morphotypes of the same species. The present study aims to perform morphological and morphometric comparative analysis of the four morphotypes found in cattle from the southeastern region of Brazil. Ruminal content samples were obtained from four Holstein x Gir cattle and fixed at 18.5% formalin for morphological analysis. Morphometry was performed based on individuals stained with Lugol's solution [1]. The infraciliary bands were stained using silver carbonate impregnation technique [2]. Morphological and morphometric characterizations, supported by literature, suggest that the four morphotypes of E. posterovesiculatum are actually a single polymorphic species due to small morphometric differences and mostly identical morphological characters, with the format of the caudal processes being the only morphological characteristic that sets them apart.

Scuticociliatosis caused by Uronema sp. in ten different ornamental aquarium reef fish in Brazil / Scuticociliatose causado por Uronema sp. em dez diferentes peixes ornamentais de recife no Brasil

Abstract Scuticociliatosis, caused by an opportunistic ciliate protozoan, is responsible for significant economic losses in marine ornamental fish. This study reports the occurrence of Uronema spp., parasitizing ten species of marine reef fish at an ornamental fish wholesaler: Blue green damselfish (Chromis viridis), Vanderbilt's Chromis (Chromis vanderbilti), Pennant coralfish (Heniochus acuminatus), Threespot angelfish (Apolemichthys trimaculatus), Goldspotted angelfish (Apolemichthys xanthopunctatus), Sea goldie (Pseudanthias squamipinnis), Orchid dottyback (Pseudochromis fridmani), Threadfin butterflyfish (Chaetodon auriga), Vagabond butterflyfish (Chaetodon vagabundus), and Bluecheek butterflyfish (Chaetodon semilarvatus). Diseased fish showed disorders such as hemorrhages and ulcerative lesions on the body surface. Histopathological analysis of the muscle, liver, gut, kidney, spleen, gills, and stomach revealed hemorrhages and degeneration of muscle fiber, vacuolar degeneration of hepatocyte, inflammatory process and granuloma in the liver, atrophy of intestinal villi, inflammatory process and granuloma in the kidney, melanomacrophage centers, as well as inflammatory process in the spleen, epithelial cells hyperplasia and granuloma formation in the gills, and vacuolar degeneration and eosinophils in the stomach. Due to the severity of the disease, it is necessary to implement biosecurity measures with rapid and accurate diagnosis to minimize the risk of economic losses caused by Uronema spp.

Resumo Scuticociliatose, causada pelo protozoário ciliado oportunista, é responsável por significativas perdas econômicas em peixes marinhos ornamentais. O estudo relata a ocorrência de Uronema spp., parasitando dez espécies de peixes de recife em um distribuidor de peixes ornamentais: "Blue green damselfish" (Chromis viridis), "Vanderbilt's Chromis" (Chromis vanderbilti), "Pennant coralfish" (Heniochus acuminatus), "Threespot angelfish" (Apolemichthys trimaculatus), "Goldspotted angelfish" (Apolemichthys xanthopunctatus), "Sea goldie" (Pseudanthias squamipinnis), "Orchid dottyback" (Pseudochromis fridmani), "Threadfin butterflyfish" (Chaetodon auriga), "Vagabond butterflyfish" (Chaetodon vagabundus), e "Bluecheek butterflyfish" (Chaetodon semilarvatus). Peixes doentes apresentaram distúrbios como hemorragias e lesões ulcerativas na superfície do corpo. A análise histopatológica do músculo, fígado, intestino, rim, baço, brânquias e estômago revelou hemorragias e degeneração das fibras musculares, degeneração vacuolar de hepatócitos, processo inflamatório e granuloma no fígado, atrofia das vilosidades intestinais, processo inflamatório e granuloma no rim, centros de melanomacrófagos e processo inflamatório no baço, hiperplasia das células epiteliais, bem como formação de granuloma nas brânquias e degeneração vacuolar e eosinófilos no estômago. Devido à gravidade da doença, é necessário implementar medidas de biossegurança com diagnóstico rápido e preciso para minimizar o risco de perdas econômicas causadas por Uronema spp.

Cryptocaryon irritans, a ciliate parasite of an ornamental reef fish yellowtail tang Zebrasoma xanthurum / Cryptocaryon irritans, parasito ciliado do peixe ornamental de recife "yellowtail tang" Zebrasoma xanthurum

Abstract Cryptocaryon irritans is an obligate parasitic ciliate protozoan of wild and cultured marine fish. It causes white spot disease, and infections with this pathogen can cause significant losses for aquarists and commercial marine cultures worldwide. This study reports the occurrence of C. irritans parasitizing the ornamental reef fish, yellowtail tang, Zebrasoma xanthurum. Six days after being introduced to a new environment, 11 yellowtail tangs had white spots scattered across their bodies and fins. Suspicion of infection with C. irritans was evaluated by scraping the skin to confirm clinical diagnosis. After confirmation, the yellowtail tangs were transferred to a hospital aquarium and treated with the therapeutic agent Seachem Cupramine® for 15 days. During the treatment period, the copper concentration was monitored daily. At the end of the treatment, none of the yellowtail tangs showed clinical signs of white spots on their bodies, and skin scraping confirmed the yellowtail tangs were no longer infected. Subsequently, the yellowtail tangs were released for sale.

Resumo Cryptocaryon irritans é um protozoário ciliado parasita obrigatório de peixes marinhos selvagens e cultivados. Causa a doença dos "pontos brancos". Infecções por esse patógeno pode causar perdas significativas para aquaristas e para marinocultura comercial em todo o mundo. Este estudo relata a ocorrência de C. irritans parasitando a espécie de peixe ornamental de recife Zebrasoma xanthurum. Seis dias após serem introduzidos no novo ambiente, onze peixes apresentaram pontos brancos espalhados pelo corpo e nadadeiras. Suspeitando de infecção por C. irritans foi realizado raspado de pele para confirmar o diagnóstico clínico. Após a confirmação, os peixes foram transferidos para um aquário hospital e tratados com o agente terapêutico Seachem Cupramine® por 15 dias. Durante o período de tratamento o monitoramento da concentração de cobre foi diário através da utilização de um fotômetro. Após o final do tratamento, todos os peixes já não apresentavam mais sinais clínicos de pontos brancos pelo corpo, e foram negativos no raspado de pele, sendo foram encaminhados para comercialização.

First report of Trichodinella and new geographical records of trichodinids in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) farmed in Brazil / Primeiro relato de Trichodinella e novos registros geográficos de tricodinídeos em tilapia do Nilo (Oreochromis niloticus) cultivada no Brasil

Abstract Massive occurrence of trichodinids is frequently accompanied by serious disease in fish farms. In this study, trichodinid species from the gills and skin of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) farmed in the central-western region of Brazil (state of Goiás) were morphologically characterized. Dried slides were prepared from the parasites and were impregnated with silver nitrate (2%). Morphometric characteristics were determined and schematic drawings of the denticles were made using photomicrographs produced from the slides. Seven species of trichodinid ectoparasites (Protozoa: Ciliophora: Trichodinidae) were found parasitizing the gills: four of the genus Trichodina Ehrenberg, 1838; one of Tripartiella Lom, 1959; one of Paratrichodina Lom, 1963; and one of Trichodinella Ṧrámek-Huṧek, 1953. On the body surface, three specimens of the genus Trichodina were identified. This study presents new geographical records of trichodinids in Brazil, thus confirming that Trichodina centrostrigeata, Trichodina compacta, Trichodina heterodentata, Paratrichodina africana and Tripartiella orthodens are widely distributed worldwide. Additionally, the first record of the genus Trichodinella in Brazil is presented.

Resumo O parasitismo intenso por tricodinídeos está frequentemente relacionado à doença grave em fazendas de peixes. Neste estudo, espécies de tricodinídeos das brânquias e da pele de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) cultivadas na região centro-oeste do Brasil (estado de Goiás) foram caracterizadas morfologicamente. As lâminas secas foram preparadas a partir dos parasitas e impregnadas com nitrato de prata (2%). As características morfométricas foram determinadas e desenhos esquemáticos dos dentículos foram confeccionados com fotomicrografias produzidas a partir das lâminas. Sete espécies de ectoparasitos tricodinídeos (Protozoa: Ciliophora: Trichodinidae) foram encontradas parasitando as brânquias: quatro do gênero Trichodina Ehrenberg, 1838; um de Tripartiella Lom, 1959; um de Paratrichodina Lom, 1963; e um de Trichodinella Ṧrámek-Huṧek, 1953. Na superfície do corpo, três espécimes do gênero Trichodina foram identificados. Este estudo apresenta novos registros geográficos de tricodinídeos no Brasil, confirmando que Trichodina centrostrigeata, Trichodina compacta, Trichodina heterodentata, Paratrichodina africana e Tripartiella orthodens estão amplamente distribuídas mundialmente. Adicionalmente, é apresentado o primeiro registro do gênero Trichodinella no Brasil.

Association of Epistylis spp. (Ciliophora: Peritrichia) with parasitic crustaceans in farmed piava Megaleporinus obtusidens (Characiformes: Anostomidae) / Associação de Epistylis spp. (Ciliophora: Peritrichia) com crustáceos parasitas em piava Megaleporinus obtusidens de cultivo (Characiformes: Anostomidae)

Abstract Parasitic diseases have caused significant problems to global aquaculture production. These studies will further our knowledge of this complex problem and help implement adequate prevention measures and control strategies. The present study aimed to investigate the presence of parasites in Megaleporinus obtusidens and to describe the epidemiology and pathology of parasitic infections in these fish. Five moribund fish were sent for parasitological examination. The integument and gills were scrapped off with a glass slide, and samples were examined under a light microscope. Parasitic crustaceans found in these specimens were submitted for scanning electron microscopy and histological analyses. The crustaceans Dolops carvalhoi and Lernaea cyprinacea and the Epistylis spp. were present in all fish examined. Epistylis spp. were also seen on the entire surface of the crustacean integument. Microscopic lesions observed in the parasitized gills included hyperplasia and hypertrophy of the lamellar epithelium, an inflammatory infiltrate, telangiectasia, foci of hemorrhage and necrosis, fusion of the secondary lamellae, and detachment of the lamellar epithelium. Crustacean parasites are important mechanical vectors of Epistylis infection and disseminate the disease in fish farming operations. Epistylis spp. infection affects the health of fish and has significant ecological and economical impact on aquaculture.

Resumo Doenças parasitárias causam problemas significativos a produção mundial de peixes. Esse estudo aprofundará nosso conhecimento neste complexo problema e ajudará implementar estratégias de prevenção e controle. O objetivo deste trabalho foi analisar os parasitas encontrados em Megaleporinus obtusidens de piscicultura extensiva e descrever as relações epidemiológicas e patológicas entre eles. Cinco peixes moribundos foram enviados para análise parasitológica. O tegumento e as brânquias foram raspados com lâminas de vidro e examinados em microscópio óptico. Os crustáceos parasitas foram processados para análises histologicas e de microscopia eletrônica de varredura. Todos os peixes analisados foram infestados pelos crustáceos Dolops carvalhoi, Lernaea cyprinacea e pelo Epistylis spp. Epistylis spp. foram também encontrados na superfície de todo tegumento dos crustáceos parasitas. As brânquias parasitadas apresentaram hiperplasia e hipertrofia do epitélio lamelar, infiltrado inflamatório, telangectasia, focos hemorrágicos e necróticos, extensas áreas com fusão de lamelas secundárias e desprendimento de epitélio lamelar. Os crustáceos parasitas são vetores mecânicos importantes da epistilíase, disseminando o microorganismo nas criações de peixes. A infestação por Epistylis spp. afeta a saúde dos peixes e tem impacto ecológico e econômico significativo na aquacultura.

Using in situ flow cytometry images of ciliates and dinoflagellates for aquatic system monitoring / Usando imagem de citometria de fluxo in situ de ciliados e dinoflagelados para o monitoramento de sistemas aquáticos

Abstract Short-period variability in plankton communities is poorly documented, especially for variations occurring in specific groups in the assemblage because traditional analysis is laborious and time-consuming. Moreover, it does not allow the high sampling frequency required for decision making. To overcome this limitation, we tested the submersible CytoSub flow cytometer. This device was anchored at a distance of approximately 10 metres from the low tide line at a depth of 1.5 metres for 12 hours to monitor the plankton at a site in the biological reserve of Barra da Tijuca beach, Rio de Janeiro. Data analysis was performed with two-dimensional scatter plots, individual pulse shapes and micro images acquisition. High-frequency monitoring results of two interesting groups are shown. The abundance and carbon biomass of ciliates were relatively stable, whereas those from dinoflagellates were highly variable along the day. The linear regression of biovolume measures between classical microscopy and in situ flow cytometry demonstrate high degree of adjustment. Despite the success of the trial and the promising results obtained, the large volume of images generated by the method also creates a need to develop pattern recognition models for automatic classification of in situ cytometric images.

Resumo A variabilidade de curto período em comunidades do plâncton é pouco documentada, especialmente as variações que ocorrem em grupos específicos das assembleias por causa das análises tradicionais serem muito trabalhosas e demoradas. Além disso, não permitem que a alta frequência amostral necessária para a tomada de decisão. Para superar esta limitação, nós testamos o CytoSub, um citômetro de fluxo submersível. Este aparelho foi ancorado a aproximadamente 10 metros de distância da linha de maré baixa a uma profundidade de 1,5 metros por 12 horas para monitorar o plâncton em um sítio da reserva biológica da praia da Barra da Tijuca, Rio de Janeiro. A análise dos dados foi realizada a partir de gráficos de dispersão bidimensionais, pelas assinaturas ópticas individuais escaneadas (pulse shape profile) e aquisição de micro imagens. Resultados do monitoramento de alta frequência de dois grupos interessantes são apresentados. A abundância e a biomassa de carbono de um grupo de ciliados foram relativamente estáveis, ao passo que o grupo de dinoflagelado, foi altamente variável ao longo do dia. O modelo de regressão linear das medidas de biovolume entre a clássica microscopia e a citometria de fluxo in situ apresentou alto grau de ajustamento. Apesar do sucesso deste ensaio e dos resultados promissores obtidos, o grande volume de imagens geradas por este método também gerou a necessidade de se desenvolver modelos de reconhecimento de padrões para a classificação automática de imagens de citometria in situ.

Protozoa ciliates community structure in urban streams and their environmental use as indicators / Estrutura da comunidade de protozoários ciliados em córregos urbanos e sua utilização como indicadores

Abstract The objective of this work was to investigate the patterns of diversity and abundance of ciliates protozoa community in three tropical urban streams and verify which species can be considered bioindicators of water quality. In each stream, three regions (headwater, middle and mouth) were sampled in two years, in the rainy and dry seasons. The abiotic factors (dissolved oxygen, pH, temperature, turbidity, width, depth, flow and conductivity) and biotic factors (total coliforms, bacterioplankton, chlorophyll and flagellates) were analyzed using appropriate methods and ciliates were identified and counted through specialized literature. We identified 84 species distributed into 24 orders. Peniculida was the most representative order followed by Prorodontida. The RDA scores showed a spatial difference between streams. On the other hand, regarding the temporal variation, there was no separation of the sampled data. The Indval analysis showed ten species indicators, such as Coleps hirtus, Euplotes moebiusi and Tintinidium pusillum. The Cluster analysis per stream versus period showed a greater distinction of the streams in the dry season. On the other hand, a low similarity was observed between sections within the same stream. In summary, the results indicated that the ciliates can be used as important tools as bioindicators in lotic environments affected by different degrees of pollution, due to the fact that they have short life cycle, allowing the detection of impacts on a small time scale, as well as by having direct answers to environmental changes and high sensitivity to contaminants.

Resumo O objetivo deste trabalho foi investigar os padrões de diversidade e abundância da comunidade de protozoários ciliados em três córregos urbanos tropicais, bem como verificar quais espécies podem ser consideradas bioindicadoras da qualidade da água. Em cada córrego foram amostradas três regiões (cabeceira, intermediária e foz) em dois anos, nas estações chuvosa e seca. Os fatores abióticos (oxigênio dissolvido, pH, temperatura, turbidez, largura, profundidade, fluxo e condutividade) e fatores bióticos (coliformes totais, bacterioplâncton, clorofila e flagelados) foram analisados ​​por metodologia específica e os ciliados foram contados e identificados por meio de literatura especializada. Foram identificadas 84 espécies distribuídas em 24 ordens. Peniculida foi a ordem mais representativa, seguida por Prorodontida. Os escores da RDA mostraram uma diferença espacial entre os córregos. Por outro lado, em relação à variação temporal, não houve separação entre os dados amostrados. A análise Indval mostrou dez espécies indicadoras, como Coleps hirtus, Euplotes moebiusi e Tintinidium pusillum. A análise de Cluster realizada por riacho versus período evidenciou uma maior distinção dos córregos no período seco. Por outro lado, foi observada uma baixa similaridade entre os locais dentro do mesmo córrego. Em síntese, os resultados indicaram que os ciliados podem ser utilizados como ferramentas importantes como bioindicadores em ambientes lóticos afetados por diferentes graus de poluição, devido ao fato de apresentarem um curto ciclo de vida, permitindo a detecção de impactos em uma pequena escala de tempo, bem como por apresentarem respostas diretas às mudanças ambientais e alta sensibilidade a contaminantes.

Efeito da inclusão da torta de macaúba na população de protozoários do rúmen de vacas leiteiras / The effect of macauba meal inclusion in the ruminal protozoa population of dairy cows

Avaliaram-se os efeitos da inclusão da torta de macaúba (TM) na dieta sobre a concentração e o perfil da população de protozoários ciliados do rúmen. Foram utilizadas oito vacas Holandesas, dispostas em dois quadrados latinos 4x4 e alimentadas com diferentes níveis de inclusão da TM (0, 100, 200 e 300g kg-1 de matéria seca na dieta total). Para quantificação e identificação dos protozoários, amostras de 1mL do líquido ruminal de cada animal foram diluídas em 9mL de solução de formaldeído a 10%. Após diluições decimais sucessivas em solução salina, os protozoários foram quantificados em câmara de Sedgewick. A identificação foi realizada sob a luz da microscopia óptica, utilizando-se a objetiva de 40x para caracterizar o mínimo de 100 indivíduos por amostra. As concentrações de protozoários pequenos (P<0,01), médios (P=0,05), grandes (P=0,01) e o número total (P<0,01) apresentaram comportamento linear decrescente com o aumento dos níveis de inclusão da TM nas dietas. Foram encontradas características morfológicas típicas de 16 gêneros de protozoários ciliados, sendo os gêneros Entodinium e Eodinium os mais frequentes no líquido ruminal dos animais avaliados. O perfil da população de protozoários ciliados sofreu pequenas alterações com a inclusão da TM, sendo observada alteração na participação percentual dos gêneros Charonina (P = 0,03) e Polyplastron (P<0,01). A utilização da TM na dieta de bovinos promove redução na concentração e modificação no perfil da população de protozoários ciliados do rúmen.

The effects of meal macaúba (MM) inclusion on the concentration and profile of the ciliate protozoa of the bovine rumen were evaluated. Eight Holstein cows were used during second lactation, with average 480 kg of body weight, arranged in two 4x4 Latin squares simultaneously and fed four diets with different concentrations of the MM (0, 100, 200 and 300 g kg-1). For identification and quantification of protozoa, samples of ruminal fluid from each animal with 1 ml were diluted in 9mL of 10% formaldehyde. After consecutive decimal dilutions in saline solution, protozoa were assessed in a Sedgewick chamber. The identification was carried out under the optical light microscope using a 40x objective to characterize at least 100 individuals per sample. The concentrations of small (P<0.01), medium (P=0.05), large (P= 0.01), and the total number (P<0.01) of protozoa decreased linearly with the increasing MM inclusion. Morphological characteristics typical of 16 genera of ciliates were found, being the Entodinium spp. and Eodinium spp. the most frequent in the rumen fluid of animals evaluated. The profile of the population of ciliated protozoa suffer minor changes with the addition of MM, with a change in the percentage share of Charonina spp. (P = 0.03) and Polyplastron spp. (P <0.01). The use of the MM in the cattle diet promotes reduction in the concentration and change in the profile of the population of rumen ciliates protozoa.

Phylogenomics of non-model ciliates based on transcriptomic analyses

Ciliates are one of the oldest living eukaryotic unicellular organisms, widely distributed in the waters around the world. As a typical marine oligotrich ciliate, Strombidium sulcatum plays an important role in marine food webs and energy flow. Here we report the first deep sequencing and analyses of RNA-Seq data from Strombidium sulcatum. We generated 42,640 unigenes with an N50 of 1,451 bp after de novo assembly and removing rRNA, mitochondrial and bacteria contaminants. We employed SPOCS to detect orthologs from S. sulcatum and 17 other ciliates, and then carried out the phylogenomic reconstruction using 127 single copy orthologs. In phylogenomic analyses, concatenated trees have similar topological structures with concordance tree on the class level. Together with phylogenetic networks analysis, it aroused more doubts about the placement of Protocruzia, Mesodinium and Myrionecta. While epiplasmic proteins are known to be related to morphological characteristics, we found the potential relationship between gene expression of epiplasmic proteins and morphological characteristics. This work supports the use of high throughput approaches for phylogenomic analysis as well as correlation analysis between expression level of target genes and morphological characteristics.

A New Record of Volutella ciliata Isolated from Crop Field Soil in Korea

During a survey of fungal species in South Korea, a species of Volutella ciliata was isolated and described based on the analysis of the internal transcribed spacer region of its rDNA and its morphological characteristics. This is the first record of Volutella ciliata isolated from crop field soil in Korea.

The importance of protozoan bacterivory in a subtropical environment (Lobo-Broa Reservoir, SP, Brazil) / A importância da bacterivoria por protozoários em um ambiente subtropical (Reservatório do Lobo-Broa, SP, Brasil)

This study evaluated the importance of heterotrophic nanoflagellates (HNF) and ciliates bacterivory in a mesotrophic subtropical environment (Lobo-Broa Reservoir, Brazil) by the quantification of their ingestion rates. The in situ experiments using fluorescently labelled bacteria (FLB) were carried out bimonthly over one year (three surveys in the dry season and three in the rainy one) at the sub-surface of two sampling points that have different trophic degrees. The ingestion rates for both ciliates and HNF were higher in the meso-eutrophic region (point 2) due to the higher water temperatures, which accelerate the metabolism of protozoans and the higher bacteria densities. Concerning total protozoan bacterivory, the HNF had the greatest grazing impact on bacterial community, especially the HNF <5µm. The data showed that HNF grazing, in addition to regulating the bacteria abundance, also induced changes to the bacterial community structure, such as increasing size and numbers of bacterial filaments. The ciliates were also important to the system bacterivory, especially in point 2, where there were high densities and ingestion rates. The protozoan bottom-up control was more important in the dry season and the top-down control was more important in the rainy season, so, these two forces are equally important to the bacterial abundance regulation in this reservoir in an annual basis.

Este estudo avaliou a importância da bacterivoria por nanoflagelados heterotróficos (NFH) e ciliados em um ambiente subtropical mesotrófico (Reservatório do Lobo-Broa, Brasil) pela quantificação de suas taxas de ingestão. Os experimentos in situ utilizando bactérias marcadas por fluorescência (FLB) foram realizados bimestralmente durante um ano (três estudos no período seco e três no período chuvoso) na superfície de dois pontos de coleta que apresentam graus de trofia diferentes. As taxas de ingestão, tanto para os ciliados quanto para os NHF, foram maiores no ponto 2 (P2) devido provavelmente as maiores temperaturas da água, que aceleram o metabolismo dos protozoários, e as maiores densidades de bactérias. Em relação à bacterivoria total por protozoários, as populações de NFH causaram maior impacto de predação sobre a comunidade bacteriana do reservatório, principalmente os NFH menores que 5µm. Os dados indicaram que a predação por NFH, além de regular a abundância de bactérias, provavelmente também induziu modificações na estrutura da comunidade bacteriana, como o aumento do tamanho e da quantidade de filamentos bacterianos. Os ciliados também contribuíram significativamente para a bacterivoria no sistema, principalmente no P2, onde apresentaram altas densidades e taxas de ingestão. O controle bottom-up teve maior importância no período seco e o controle top-down maior importância no período chuvoso, assim, estas duas forças são igualmente importantes na regulação da abundância bacteriana neste reservatório em uma base anual.

Protozoans bacterivory in a subtropical environment during a dry/cold and a rainy/warm season

In aquatic ecosystems, bacteria are controlled by several organisms in the food chain, such as protozoa, that use them as food source. This study aimed to quantify the ingestion and clearance rates of bacteria by ciliates and heterotrophic nanoflagellates (HNF) in a subtropical freshwater reservoir (Monjolinho reservoir -São Carlos -Brazil) during one year period, in order to verify their importance as consumers and controllers of bacteria in two seasons, a dry/cold and a rainy/warm one. For this purpose, in situ bacterivory experiments were carried out bimonthly using fluorescently labeled bacteria with 5-(4,6 diclorotriazin-2yl) aminofluorescein (DTAF). Although ciliates have shown the highest individual ingestion and clearance rates, bacterivory was dominated by HNF, who showed higher population ingestion rates (mean of 9,140 bacteria h-1mL-1) when compared to ciliates (mean of 492 bacteria h-1mL-1). The greater predation impact on bacterial communities was caused mainly by the small HNF (< 5 µm) population, especially in the rainy season, probably due to the abundances of these organisms, the precipitation, trophic index state and water temperature that were higher in this period. Thus, the protozoan densities together with environmental variables were extremely relevant in determining the seasonal pattern of bacterivory in Monjolinho reservoir.

Structure of planktonic ciliates community (Protist, Ciliophora) from an urban lake of southern Brazil / Estrutura da comunidade de ciliados planctônicos (Protista, Ciliophora) de um lago urbano do Sul do Brasil

This study examined temporal and spatial (vertical) variations of composition, richness and abundance of the planktonic ciliates community in an urban and eutrophic lake, as well as identified the limnological factors involved in determining the patterns observed. To this end, samples of ciliates and measures of limnological variables were taken at different depths and hydrological periods. 35 ciliate species were identified, among which 14 species occurred in all periods and strata, being Prostomatida the most specious, followed by Gymnostomatida, Oligotrichida, Peritrichida, and Scuticociliatida. The patterns found for composition, abundance and species richness evidenced a vertical and temporal variation of these attributes. However, in general the composition and species richness have varied more along the vertical gradient than between periods, whereas for the abundance, only temporal differences could be detected. Results observed herein indicated that benthic species seem to be mainly influenced by the amount of organic matter, phosphorus and ammonia, while planktonic ones, abundant at the surface, were mainly associated with higher dissolved oxygen concentrations. In this way, seasonal and vertical variations of limnological characteristics were decisive for the patterns of occurrence and abundance of ciliate species.

O presente estudo teve como objetivo investigar as variações temporais e espaciais (vertical) da composição, riqueza de espécies e abundância da comunidade de ciliados planctônicos em um lago urbano, eutrófico, e identificar alguns fatores limnológicos intervenientes na determinação dos padrões observados. Para tal, amostras de ciliados, bem como as mensurações das variáveis limnológicas foram obtidas em diferentes profundidades e períodos hidrológicos. Trinta e cinco espécies de ciliados foram identificadas, das quais 14 ocorreram em ambos os períodos e estratos. Prostomatida foi a ordem com maior número de espécies, seguida por Gymnostomatida, Oligotrichida, Peritrichida e Scuticociliatida. A composição e riqueza de espécies, em geral, variaram mais verticalmente que temporalmente, enquanto que para a abundância, diferenças foram observadas apenas entre os períodos hidrológicos Os resultados indicaram que espécies bentônicas parecem ser influenciadas principalmente pela quantidade de matéria orgânica, fósforo total e amônia, enquanto que as espécies planctônicas, abundantes na superfície, estiveram principalmente associadas com as maiores concentrações de oxigênio dissolvido. Desta forma, as variações sazonais e verticais das características limnológicas foram decisivas na determinação dos padrões de ocorrência e abundância de espécies de ciliados.